Powstał na początku XVII w. Został ufundowany przez Mikołaja Borka z Trzcińca. Pozostałością pierwszej murowanej światynii są mury nawy głównej wraz z kwadratową kaplicą św. Mikołaja.
25 maja 2015 r. w dworze mogilańskim została otwarta Akademia Mieszkańców. Pomysłodawcą i moderatorem Akademii jest prof. Andrzej Zoll. Organizatorem Stowarzyszenie Mieszkańców Gminy Mogilany.
Bez reklamy, bez pieniędzy, ale za to z udziałem wspaniałych gości ruszyła Akademia Mieszkańców w Mogilanach. TVP Kraków przedstawi naszą Akademię we wtorek o godz. 20.05 w programie "Region. Ludzie, sprawy, opinie".